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    靶標篩選

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    泛素化label free

    泛素化是一種廣泛存在的翻譯后修飾(PTMs)。泛素化是指泛素(一類低分子量的蛋白質)分子在一系列特殊的酶作用下,將細胞內的蛋白質分類,從中選出靶蛋白分子,并對靶蛋白進行特異性修飾的過程,與蛋白質降解和功能調控密切相關的翻譯后修飾形式。泛素化在蛋白質的定位、代謝、功能、調節和降解中都起著十分重要的作用,同時它也參與了細胞周期、增殖、凋亡、分化、轉移、基因表達、轉錄調節、信號傳遞、損傷修復、炎癥免疫等幾乎一切生命活動的調控,與腫瘤、心血管等疾病的發病密切相關。

    帶有泛素化修飾的肽段比例很低,其他大量存在的肽段會影響泛素化肽段質譜信號的鑒定,因此在質譜檢測前需要對泛素化肽段進行富集。Trypsin酶切后的泛素化修飾是一個較小的Motif(K-GG),采用具有高親和力的基序抗體,能夠特異性富集復雜樣本中的泛素化肽段,結合label free蛋白質定量方法,實現大規模泛素化蛋白質定性定量分析。

    技術流程


    吉凱基因優勢

    1. 軟硬件先進(儀器為QE,QE PLUS, HF X,軟件為MaxQuant);

    2. 采用CST泛素化肽段富集試劑盒,確保富集效果穩定有效;

    3. 質控嚴格(預實驗中每個樣本都需要進行蛋白質級別和預質譜級別的質檢,不合格的給予合理建議。同時對儀器條件進行嚴格監控,發現不合格則重新開展實驗,確保實驗數據有效);

    4. 專業的團隊(團隊成員經驗豐富,能處理幾乎所有類型的樣本分析);

    5. 強大的生信分析團隊(除GO,KEGG等常規的分析外,還能進行IPA、趨勢聚類、蛋白質相互作用以及其他個性化分析)。

    參考文獻

    Wagner SA, Beli P, Weinert BT, Sch?lz C, Kelstrup CD, Young C, Nielsen ML, Olsen JV, Brakebusch C, Choudhary C, Proteomic analyses reveal divergent ubiquitylation site patterns in murine tissues, Mol Cell Proteomics. 2012 Dec;11(12):1578-85.

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